48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1797 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  319  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  51.2 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  51.2 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  160  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  47.83 
 
 		 186 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  38.92 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  34.78 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  35.58 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  36.2 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  36.2 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  36.2 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  34.15 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  32.73 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  32.73 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  36.3 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  32.73 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  32.72 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  33.54 
 
 		 168 aa  87.4  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  32.32 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  28.31 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  27.61 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  38.32 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  36.54 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  35.22 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  31.1 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  29.46 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  29.38 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  26.58 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  33.04 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  28.42 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  28.08 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  30.92 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  25.61 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2101  hypothetical protein  23.65 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.175881  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  24.11 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3867  hypothetical protein  30.69 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1777  hypothetical protein  23.65 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0230  hypothetical protein  24.84 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  25.2 
 
 		 183 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4125  hypothetical protein  26.87 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2908  hypothetical protein  26.12 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00873066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3450  hypothetical protein  26.87 
 
 		 197 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.603459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1788  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1923  hypothetical protein  26.87 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1342  hypothetical protein  30.11 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>