120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1923 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4125  hypothetical protein  93.33 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2137  hypothetical protein  89.53 
 
 		 194 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000987674  hitchhiker  0.00718349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3450  hypothetical protein  82.74 
 
 		 197 aa  330  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.603459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6250  hypothetical protein  84.38 
 
 		 193 aa  325  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2908  hypothetical protein  82.98 
 
 		 197 aa  311  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00873066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2480  hypothetical protein  81.38 
 
 		 196 aa  300  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3867  hypothetical protein  63.9 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1083  hypothetical protein  62.43 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5522  hypothetical protein  61.54 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2019  hypothetical protein  59.09 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1937  hypothetical protein  59.69 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0792  hypothetical protein  59.69 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1084  hypothetical protein  59.69 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0625  hypothetical protein  59.69 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0528  hypothetical protein  59.69 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2057  hypothetical protein  59.69 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2470  hypothetical protein  58.1 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.433224  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2272  hypothetical protein  67.07 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00317915  normal  0.0200379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1414  hypothetical protein  64.33 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531189  normal  0.0304198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5884  hypothetical protein  61.54 
 
 		 194 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2232  hypothetical protein  63.74 
 
 		 201 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2193  hypothetical protein  61.54 
 
 		 194 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2218  hypothetical protein  61.54 
 
 		 194 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2111  hypothetical protein  63.74 
 
 		 201 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1940  hypothetical protein  64.71 
 
 		 191 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2231  hypothetical protein  63.33 
 
 		 177 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3135  hypothetical protein  63.53 
 
 		 203 aa  220  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177362  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1796  hypothetical protein  59.16 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2525  hypothetical protein  56.04 
 
 		 212 aa  217  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2543  hypothetical protein  60.1 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2881  hypothetical protein  57.29 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  0.292612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1808  hypothetical protein  61.02 
 
 		 176 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2048  hypothetical protein  57.36 
 
 		 200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0224363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2101  hypothetical protein  60.77 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.175881  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1954  hypothetical protein  60.33 
 
 		 179 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal  0.160176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1066  hypothetical protein  57.14 
 
 		 203 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0982  hypothetical protein  57.14 
 
 		 193 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.524883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3216  hypothetical protein  55.45 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0618648  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1777  hypothetical protein  60.77 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1498  hypothetical protein  55.88 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1384  hypothetical protein  53.88 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2746  hypothetical protein  57.44 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0875  hypothetical protein  58.97 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.437041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1628  hypothetical protein  58.47 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511359  normal  0.669453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3064  hypothetical protein  55.78 
 
 		 197 aa  197  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0016  hypothetical protein  52.66 
 
 		 215 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1847  hypothetical protein  52 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1844  hypothetical protein  52 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1788  hypothetical protein  38.12 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3326  hypothetical protein  42.42 
 
 		 178 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1525  hypothetical protein  36.59 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00081824  normal  0.11672 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2515  hypothetical protein  39.38 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0497  hypothetical protein  36.69 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0016  hypothetical protein  37.87 
 
 		 162 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0594  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0463064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  37.42 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40830  hypothetical protein  33.53 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1880  hypothetical protein  37.08 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1202  hypothetical protein  34.91 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000824921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0431  hypothetical protein  36.78 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0345  hypothetical protein  38.92 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0682824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4257  hypothetical protein  34.97 
 
 		 162 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0230  hypothetical protein  35.52 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60530  hypothetical protein  36.48 
 
 		 162 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012244  normal  0.488728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5214  hypothetical protein  36.48 
 
 		 162 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000310717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3084  hypothetical protein  35.15 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4583  hypothetical protein  34.97 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4866  hypothetical protein  34.91 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02877  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0695  conserved hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02827  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0494  hypothetical protein  37.85 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3161  hypothetical protein  33.9 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.604205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0512  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3181  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3471  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0692  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3288  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3431  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3230  hypothetical protein  35.36 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3407  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3401  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.572659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3336  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.568765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3327  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4314  hypothetical protein  35.5 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4503  hypothetical protein  34.91 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55256  normal  0.737083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0780  hypothetical protein  35.33 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1342  hypothetical protein  34.36 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0714  hypothetical protein  34.91 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3502  hypothetical protein  34.91 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0682  hypothetical protein  34.91 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0436  hypothetical protein  34.88 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00784425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0713  hypothetical protein  34.91 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.028943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2386  hypothetical protein  34.91 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0339  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.818951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0033  hypothetical protein  33.93 
 
 		 164 aa  112  5e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2816  hypothetical protein  35.15 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.681975  normal  0.0187952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3655  hypothetical protein  35.33 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0069  hypothetical protein  33.13 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>