26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1558 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1558  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.280384  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1343  hypothetical protein  50.69 
 
 
153 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  43.03 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  31.76 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  30.59 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  30.86 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  31.18 
 
 
185 aa  87.8  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1166  hypothetical protein  28.82 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.177287  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0528  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0114 domain protein)  27.91 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0766  hypothetical protein  28.82 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1041  hypothetical protein  28.82 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0318  hypothetical protein  32.43 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  31.65 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1457  hypothetical protein  27.49 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1014  hypothetical protein  28.74 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1469  hypothetical protein  30.72 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1310  hypothetical protein  31.65 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221005  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3134  hypothetical protein  29.81 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0455  hypothetical protein  28.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.313734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4326  hypothetical protein  29.27 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.460379  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3708  hypothetical protein  30.26 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1797  hypothetical protein  31.31 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  28.03 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  29.63 
 
 
183 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01366  hypothetical protein  24.03 
 
 
173 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>