22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0197 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0197  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  356  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2648  hypothetical protein  36.81 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1912  hypothetical protein  35.29 
 
 
161 aa  88.2  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.441349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1614  hypothetical protein  37.84 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1520  hypothetical protein  33.12 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1911  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.213831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1738  hypothetical protein  34.21 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1724  hypothetical protein  32.5 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.937912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1959  hypothetical protein  34.75 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12280  predicted membrane protein  34.68 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1547  hypothetical protein  28.29 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  0.0608905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0008  hypothetical protein  29.81 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.332739  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1409  hypothetical protein  27.1 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0045  hypothetical protein  27.61 
 
 
232 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3213  hypothetical protein  32.99 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.760781  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1231  hypothetical protein  32.28 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000824978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0411  hypothetical protein  24.73 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.647586  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0635  hypothetical protein  34.31 
 
 
172 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0856  hypothetical protein  24.22 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0332597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0160  hypothetical protein  23.6 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1747  hypothetical protein  23.6 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.371305  normal  0.157738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3624  hypothetical protein  32.41 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>