More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2474 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2474  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 405 aa  820    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1553  3-dehydroquinate synthase  57.96 
 
 		 385 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2287  3-dehydroquinate synthase  54.19 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.271495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2884  3-dehydroquinate synthase  53.12 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7262  3-dehydroquinate synthase  53.25 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000318615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0084  3-dehydroquinate synthase  50.91 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0428  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.989319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0984  3-dehydroquinate synthase  47.01 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2434  3-dehydroquinate synthase  48.29 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1816  3-dehydroquinate synthase  46.98 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0671  3-dehydroquinate synthase  47.09 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 363 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 366 aa  160  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 362 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.57 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  36.79 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  35.12 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  32.47 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  32.73 
 
 		 370 aa  156  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  28.65 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  37.9 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  35.1 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  37.55 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  28.68 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  29.76 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  35.59 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  37.24 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  37.8 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  37.25 
 
 		 358 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  37.76 
 
 		 370 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  34.56 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 		 381 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  34.39 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  33 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  34.94 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  35.54 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  35.53 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  37.4 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  31.91 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  33.57 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  40.69 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  34.69 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  33.22 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  35.42 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  35.07 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  32.97 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  36.18 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  35.98 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  35.98 
 
 		 345 aa  147  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  34.69 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 359 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 359 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  35.76 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 		 358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 354 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  37.65 
 
 		 363 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  36.11 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  36.11 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  36.11 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  32.54 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  33.68 
 
 		 364 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  33.68 
 
 		 364 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 		 370 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  36.69 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  33.22 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  38.11 
 
 		 615 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 		 368 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>