More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2884 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2884  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 386 aa  792    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0084  3-dehydroquinate synthase  61.1 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0428  3-dehydroquinate synthase  58.84 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.989319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7262  3-dehydroquinate synthase  56.02 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000318615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2287  3-dehydroquinate synthase  53.66 
 
 		 401 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.271495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1553  3-dehydroquinate synthase  52.48 
 
 		 385 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2474  3-dehydroquinate synthase  53.12 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0984  3-dehydroquinate synthase  51.06 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1816  3-dehydroquinate synthase  47.78 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2434  3-dehydroquinate synthase  48.04 
 
 		 402 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0671  3-dehydroquinate synthase  44.3 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  35.93 
 
 		 361 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  36.88 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  34.49 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  35.96 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  33.44 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  32.13 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  32.46 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  36.91 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  40.08 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  35.59 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  34.71 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  33.23 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  35.02 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  32.67 
 
 		 366 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  39.41 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  36.55 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  33.23 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  35.66 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  35.82 
 
 		 346 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  34.01 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  31.04 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  30.29 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  34.01 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  32.88 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  33.75 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  33.44 
 
 		 366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  32.88 
 
 		 360 aa  156  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  36.33 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  31.99 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  32.03 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  34.9 
 
 		 591 aa  155  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  36.08 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  35.11 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  32.05 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  34.64 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  34.64 
 
 		 358 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  32.69 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  36.43 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  29.36 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  37.45 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  30.96 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  29.44 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  34.54 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  35.43 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  31.62 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  34.04 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  33.03 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  29.75 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  38.17 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  33.66 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  33.92 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  36.51 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  36.51 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  36.51 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  36.51 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  35.1 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  35.53 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  37.34 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  31.37 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  33.64 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  35.02 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  35.02 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  28.18 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  34.23 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  32 
 
 		 343 aa  150  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  32.65 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  31.78 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  34.11 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  32.48 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  34.01 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>