More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2287 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2287  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
401 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.271495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1553  3-dehydroquinate synthase  56.1 
 
 
385 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2474  3-dehydroquinate synthase  54.19 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0084  3-dehydroquinate synthase  53.66 
 
 
387 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2884  3-dehydroquinate synthase  53.66 
 
 
386 aa  401  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1816  3-dehydroquinate synthase  51.04 
 
 
402 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7262  3-dehydroquinate synthase  50.26 
 
 
387 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000318615  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0428  3-dehydroquinate synthase  53.48 
 
 
394 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.989319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2434  3-dehydroquinate synthase  50.78 
 
 
402 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0984  3-dehydroquinate synthase  45.14 
 
 
397 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0671  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 
387 aa  280  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  34.06 
 
 
367 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  41.2 
 
 
346 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 
362 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  31.51 
 
 
591 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  34.26 
 
 
370 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  34.26 
 
 
370 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  35.86 
 
 
362 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  30.2 
 
 
366 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  35.84 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  37.3 
 
 
362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  33.78 
 
 
431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  34.91 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  40.09 
 
 
360 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
370 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  37.24 
 
 
343 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  33.44 
 
 
370 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  35.15 
 
 
370 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  32.14 
 
 
359 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  36.05 
 
 
374 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  34.1 
 
 
370 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  34.45 
 
 
361 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  34.32 
 
 
360 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  34.77 
 
 
364 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  34.77 
 
 
364 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  34.32 
 
 
359 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  32.79 
 
 
367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  34.35 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  37.45 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
358 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  31.25 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  32.42 
 
 
366 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  33.91 
 
 
370 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  32.44 
 
 
361 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  37.7 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  30.95 
 
 
359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  32.44 
 
 
359 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  34.19 
 
 
362 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  37.7 
 
 
369 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  34.19 
 
 
362 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  34.19 
 
 
362 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  34.19 
 
 
362 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  32.88 
 
 
366 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 
364 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  34.19 
 
 
362 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  33.8 
 
 
383 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  30.95 
 
 
359 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  33.99 
 
 
369 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  28.21 
 
 
358 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  35.27 
 
 
362 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  29.59 
 
 
359 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  31.75 
 
 
358 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  31.75 
 
 
358 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  31.97 
 
 
376 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  33.59 
 
 
361 aa  143  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  30.8 
 
 
363 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  31.75 
 
 
358 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  33.71 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3533  3-dehydroquinate synthase  34.52 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.87546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  34.21 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  31.84 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  31.02 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  35.52 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  31.31 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  32 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  31.45 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  34.25 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  32.62 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  34.4 
 
 
388 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  32.89 
 
 
358 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  33.1 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  31.13 
 
 
341 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  31.42 
 
 
361 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  35.34 
 
 
354 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  31.4 
 
 
376 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  31.51 
 
 
359 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  32.17 
 
 
360 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  32.75 
 
 
359 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  36.8 
 
 
345 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  32.74 
 
 
350 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  31.56 
 
 
341 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  32.3 
 
 
358 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  30.38 
 
 
382 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1088  3-dehydroquinate synthase  34.83 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  30.39 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>