More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1553 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1553  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 385 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2287  3-dehydroquinate synthase  56.1 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.271495 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2474  3-dehydroquinate synthase  57.96 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0084  3-dehydroquinate synthase  52.73 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2884  3-dehydroquinate synthase  52.48 
 
 		 386 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0428  3-dehydroquinate synthase  53.4 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.989319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7262  3-dehydroquinate synthase  52.07 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000318615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1816  3-dehydroquinate synthase  48.18 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2434  3-dehydroquinate synthase  47.66 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0984  3-dehydroquinate synthase  46.21 
 
 		 397 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0671  3-dehydroquinate synthase  41.36 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  35.37 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  34.15 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  34.22 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  30.59 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  35.64 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  35.79 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  37.63 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  35.08 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  35.65 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  31.07 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  33.24 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  34.57 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  31.91 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  34.17 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  34.57 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  31.96 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  31.52 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  35.69 
 
 		 367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  34.57 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  35.47 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  36.76 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  34.43 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  34.8 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  34.2 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  33.62 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  34.07 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  30.97 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  34.46 
 
 		 381 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  36.1 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  35.02 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  35.14 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  35.78 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  31.34 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  33.72 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  32.78 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  30.14 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  36.29 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  32.05 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  37.15 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  32.5 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  34.89 
 
 		 366 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  39.01 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  37.38 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  34.01 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  37.87 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  35.03 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  32.96 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  32.95 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  32.56 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  33.43 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  32.29 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.9 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  33.43 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  34.78 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  32.18 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  29.03 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  32.04 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  35.35 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  34.32 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  28.9 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  40.19 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  33.97 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  35.92 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  32.96 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  33.2 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  33.76 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>