More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0671 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0671  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 387 aa  793    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2884  3-dehydroquinate synthase  44.3 
 
 		 386 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7262  3-dehydroquinate synthase  43.77 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000318615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0084  3-dehydroquinate synthase  44.24 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2474  3-dehydroquinate synthase  47.09 
 
 		 405 aa  315  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0984  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2287  3-dehydroquinate synthase  42.02 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.271495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0428  3-dehydroquinate synthase  43.89 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.989319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1553  3-dehydroquinate synthase  41.36 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1816  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2434  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  37.76 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  34.41 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  34.67 
 
 		 367 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  35.76 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  33.79 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  34.01 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  33.86 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  39.16 
 
 		 366 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  32.85 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  35.55 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  31.76 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  35.55 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  33.67 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  39.48 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  37.19 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  31.53 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  33.67 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  33.67 
 
 		 358 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  32.43 
 
 		 358 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  31.87 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  31.53 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  31.53 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  31.53 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  31.53 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  37.8 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 358 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  30.2 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  30.96 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  35.67 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  32.7 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  33.12 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  35.33 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  32.57 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  35.33 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.08 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  35.33 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  34.22 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.08 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  34.22 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  34.87 
 
 		 591 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  37.64 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  32.28 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  36.07 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  35.61 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  30.27 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  32.06 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  33.11 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  31.02 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  35.59 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  31.33 
 
 		 366 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  36.4 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  29.94 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  33.86 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  32.03 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  33.86 
 
 		 343 aa  143  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  33.21 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 358 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  32.1 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  31.55 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  31.55 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  33.56 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  33.11 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  35.59 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  31.55 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  35.16 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  31.55 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  32.82 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  31.42 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  32.67 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  31.25 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  29.25 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.27 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  30.18 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  31.27 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  30.43 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>