More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0327 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0327  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00145827  hitchhiker  0.00759583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.13 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.16 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.12 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.12 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.61 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.26 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.09 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.07 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  38.52 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  38.41 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.64 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.18 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.33 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.19 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.24 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  40.62 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.41 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.25 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  36.97 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.98 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.75 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  37.65 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  41.41 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0941  Holliday junction resolvase  37.13 
 
 		 204 aa  98.2  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.52 
 
 		 192 aa  97.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.38 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  42.19 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.57 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  40.15 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  35.57 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  35.53 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  35.93 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  35.93 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  35.93 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.28 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  36.09 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.6 
 
 		 192 aa  94  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 167 aa  94  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  36.24 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  34.07 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0964  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  33.56 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 		 182 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  36.2 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.36 
 
 		 202 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.28 
 
 		 171 aa  91.3  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.74 
 
 		 167 aa  91.3  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145262 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.34 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 197 aa  90.9  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1103  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.52984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.81 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  36.71 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  32.89 
 
 		 180 aa  90.5  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  37.16 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2906  Holliday junction resolvase  41.6 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>