141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2604 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2604  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 285 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0386  Polysulphide reductase NrfD  75.79 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  28.12 
 
 		 348 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  31.03 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  27.92 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  27.24 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  27.12 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  27.51 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  31.11 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  25.99 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  28.57 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  30.56 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  28.12 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  30.56 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  27.97 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  30 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  26.54 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  31.94 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  28.57 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  27.6 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  25.43 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  27.99 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  23.86 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  28.25 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  33.69 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  26.2 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  28.12 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  27.83 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0353  polysulphide reductase, NrfD  25.97 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  27.85 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  26.63 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  30.66 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.36 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.93 
 
 		 517 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.67 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  27.46 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.73 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  27.3 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  39.58 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  25.93 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  28.34 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4532  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  30.41 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.25 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  33.63 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  32 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0487  polysulphide reductase, NrfD  26.45 
 
 		 315 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  28.29 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.49 
 
 		 389 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  25.95 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  30.97 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  30.97 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  30.97 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  30.97 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0493  polysulphide reductase, NrfD  27.62 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  24.51 
 
 		 414 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  37.5 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  26.44 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  29.9 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  29.9 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  30.32 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  28.24 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.24 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0499  polysulphide reductase, NrfD  26.12 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  24.63 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  28.24 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  26.73 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  28.24 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  28.24 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  29.53 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  29.38 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1367  Polysulphide reductase NrfD  26.92 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.5 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.790103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  28.5 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  28.5 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  26.07 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.87 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  27.78 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  24.7 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0055  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 		 515 aa  49.3  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  26.52 
 
 		 330 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  27.36 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4451  polysulphide reductase NrfD  28.24 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  26.05 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  26.5 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  27.08 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  26.4 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  29.82 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  27.78 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  26.89 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  28.74 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.75 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0936  polysulphide reductase, NrfD  24.34 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00000369278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  24.39 
 
 		 411 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0508  polysulphide reductase NrfD  25.57 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  24.66 
 
 		 417 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  39.58 
 
 		 348 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4472  polysulphide reductase NrfD  26.32 
 
 		 315 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  27.98 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0484  polysulphide reductase NrfD  25.66 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>