25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1497 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  99.71 
 
 
340 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  99.41 
 
 
340 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  98.53 
 
 
340 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  99.41 
 
 
340 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  100 
 
 
340 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  42.05 
 
 
352 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  34.58 
 
 
342 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  35.59 
 
 
360 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  34.72 
 
 
360 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  34.17 
 
 
360 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  33.43 
 
 
376 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  34.37 
 
 
360 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  36.89 
 
 
361 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  34.27 
 
 
360 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  32.96 
 
 
364 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  33.05 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  35.96 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  36.15 
 
 
348 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  42.31 
 
 
347 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.06 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  25.76 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  25.39 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  26.85 
 
 
348 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  26.89 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  28.24 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>