102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0309 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  39.02 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  38.82 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  39.27 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  40.79 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1837  Polysulphide reductase NrfD  37.2 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2179  sulfur reductase, membrane subunit, putative  37.2 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.247784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  31.56 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  30.03 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  29.21 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  26.49 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1872  Polysulphide reductase NrfD  26.96 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0658  Polysulphide reductase NrfD  26.33 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.245596  hitchhiker  0.00748855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  29.14 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.99 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.47 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  29.06 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.48 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.790103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  27.41 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  30.32 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  28.17 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  27.86 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.86 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  27.86 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  27.86 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  28.17 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  27.12 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  27.86 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.67 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  27.55 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.64 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  28.48 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.59 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.32 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  28.57 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  26.48 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3178  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.33 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0936  polysulphide reductase, NrfD  30.38 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00000369278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  28.53 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  27.1 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  29.03 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  25.97 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.35 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4532  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.33 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  26.58 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  27.42 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.33 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  27.05 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1032  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.13 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0933  Polysulphide reductase NrfD  25.68 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.702618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  27.36 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  26.52 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  25.39 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  25.33 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  25.38 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  28.8 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  27.99 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2388  Polysulphide reductase NrfD  29.14 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02080  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  23.33 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  24.73 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  25.09 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  24.24 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  28.14 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2408  Polysulphide reductase NrfD  28.9 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00574451  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.21 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1888  Polysulphide reductase NrfD  27.53 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  31.85 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3762  polysulphide reductase, NrfD  27.88 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0271  Polysulphide reductase NrfD  27.39 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3835  polysulphide reductase, NrfD  27.56 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0315  polysulphide reductase, NrfD  28.21 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4283  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.83 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3960  polysulphide reductase, NrfD  27.56 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0183  polysulphide reductase, NrfD  27.51 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4151  polysulphide reductase NrfD  27.51 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0184  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.51 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1494  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase complex subunit NrfD  25.57 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0589179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  24.84 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2389  Polysulphide reductase NrfD  28.21 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.28599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2456  Polysulphide reductase NrfD  23.68 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1637  Polysulphide reductase NrfD  24.33 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000405044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0798  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.97 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  28.95 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.49 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  29.14 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  22.22 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0484  polysulphide reductase NrfD  27.47 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4472  polysulphide reductase NrfD  27.12 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  26.87 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1498  polysulphide reductase, NrfD  27.22 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00036667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  26.97 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  26.24 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.95 
 
 		 559 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  29.03 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3245  polysulphide reductase, NrfD  29.7 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1180  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.1 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0493  polysulphide reductase, NrfD  28.48 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>