80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4245 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 347 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  74.56 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  74.27 
 
 		 348 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  35.48 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  36.64 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  36.36 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  36.12 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  35.16 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  36.09 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  35.53 
 
 		 376 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  34.66 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  38.01 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  36.6 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  36.12 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  35.52 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  35.52 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  36.39 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  35.22 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  29.19 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  30.6 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  29.58 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  28.93 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  27.68 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  27.36 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  29.94 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  30.36 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  29.94 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  26.56 
 
 		 313 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  29.76 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  26.52 
 
 		 313 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  30.9 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  29.3 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  24.66 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  29.3 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  25.84 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.06 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0353  polysulphide reductase, NrfD  28.57 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  25.6 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4472  polysulphide reductase NrfD  26.5 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0487  polysulphide reductase, NrfD  25.97 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  28.66 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  28.21 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.51 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  28.21 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0484  polysulphide reductase NrfD  29.19 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  29.05 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02585  hypothetical protein  26.94 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  28.21 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  25.49 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  30.86 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  30.86 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  26.73 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.09 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  27.01 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  29.19 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  24.7 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  27.95 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  24.89 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.78 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2604  polysulphide reductase, NrfD  30.97 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0271  Polysulphide reductase NrfD  24.77 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4283  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  31.25 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  25.21 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  30.41 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.09 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  32.67 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0183  polysulphide reductase, NrfD  31.25 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  30.11 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4151  polysulphide reductase NrfD  31.25 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0184  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  31.25 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  25.97 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4451  polysulphide reductase NrfD  27.33 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  25.79 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  25.64 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0508  polysulphide reductase NrfD  26.71 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  25.45 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  24.24 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  23.83 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  33.78 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0315  polysulphide reductase, NrfD  30 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>