34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0499 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0499  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1180  Polysulphide reductase NrfD  41.78 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.77 
 
 		 517 aa  89.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1965  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  29.31 
 
 		 517 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0055  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.04 
 
 		 515 aa  75.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0357166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.6 
 
 		 531 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0026  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  25.52 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00952912  normal  0.230083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.77 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  29.08 
 
 		 565 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  23.13 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0508  polysulphide reductase NrfD  28.7 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0353  polysulphide reductase, NrfD  25.66 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 505 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  27.78 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4451  polysulphide reductase NrfD  26.85 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0493  polysulphide reductase, NrfD  27.78 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0484  polysulphide reductase NrfD  25.93 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4472  polysulphide reductase NrfD  25.93 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  22.48 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0487  polysulphide reductase, NrfD  25.93 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  25.81 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  25.81 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0494  polysulphide reductase, NrfD  28.72 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  25.42 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1021  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.84 
 
 		 512 aa  43.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.539735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  24.52 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.27 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.52 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1498  polysulphide reductase, NrfD  24.42 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00036667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.52 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  22.48 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>