More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3127 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3127  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  724    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.21286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  40.66 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  37.58 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  40.31 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.16 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.16 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.79 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.1 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.4 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.87 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  40.48 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.12 
 
 		 318 aa  216  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.13 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  36.92 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.27 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.86 
 
 		 327 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.86 
 
 		 325 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.94 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  41.2 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.32 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.74 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5507  hypothetical protein  38.1 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.11 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  39.4 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  38.94 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.74 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.58 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.89 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.86 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.37 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.04 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.12 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  38.94 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.91 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.14 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.87 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2507  hypothetical protein  35.61 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00246181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.12 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.94 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  41.03 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.89 
 
 		 304 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  38.51 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.5 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  36.79 
 
 		 332 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  36.45 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  38.85 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  35.92 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.8 
 
 		 327 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.21 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.71 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.21 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  36.47 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  33.52 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.73 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  36.53 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  33.94 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  36.75 
 
 		 323 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.7 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  37.54 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.73 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.54 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.69 
 
 		 326 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  34.47 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  37.59 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  39.93 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.74 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.42 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.24 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  39.43 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.58 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  37.21 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  38.05 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.94 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.34 
 
 		 333 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  35.87 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  36.34 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.64 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.92 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.54 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.52 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5878  hypothetical protein  38.67 
 
 		 327 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5819  hypothetical protein  39.09 
 
 		 329 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.13 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.68 
 
 		 326 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.01 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.13 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.07 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.86 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>