194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6896 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 364 aa  752    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  56.32 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  52.07 
 
 		 365 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  52.89 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  54.14 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  51.38 
 
 		 367 aa  394  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  50 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  50.55 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  49.18 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  43.96 
 
 		 364 aa  341  9e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  38.63 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.72 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  41.41 
 
 		 373 aa  249  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  41.41 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  39.36 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  41.72 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  40.8 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  40.8 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  40.8 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  35.34 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.1 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  43.32 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  37.03 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.49 
 
 		 373 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  38.87 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  39.19 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.37 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  38.95 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  36.05 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  38.28 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  35.71 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  40.18 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  37.95 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  37.69 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  41.36 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  34.24 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.83 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  36.31 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  36.36 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  36.23 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  36.71 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  36.09 
 
 		 380 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  37.19 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  34.97 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  35.33 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  32.97 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  33.61 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  31.17 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  31.44 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  31.44 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  32.42 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  33.62 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  32.25 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  32.25 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  32.25 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  35.57 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  33.24 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  34.9 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  34.95 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  31.9 
 
 		 377 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.88 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  29.19 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  31.69 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  45.19 
 
 		 103 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  37.74 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  44.9 
 
 		 105 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  26.93 
 
 		 336 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  31.45 
 
 		 279 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  38.1 
 
 		 262 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  24.57 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  37.38 
 
 		 107 aa  87  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  37.3 
 
 		 262 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  37.39 
 
 		 274 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  44.12 
 
 		 103 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0153  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296834  hitchhiker  0.0000244541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3412  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.823966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  35.92 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  40.2 
 
 		 105 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  40.2 
 
 		 105 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  31.93 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  31.75 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  44 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  41 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  23.39 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  37.86 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  30.4 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  35.85 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  37.86 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  31.75 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  37.86 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  43 
 
 		 103 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  36.36 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  41.41 
 
 		 106 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  37.86 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>