285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3302 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  760    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  56.06 
 
 
372 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  56.22 
 
 
375 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  54.86 
 
 
372 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  54.38 
 
 
388 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  50.54 
 
 
372 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  51.08 
 
 
372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  45.14 
 
 
374 aa  308  9e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  41.32 
 
 
371 aa  292  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  39.4 
 
 
372 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  39.57 
 
 
368 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  40.92 
 
 
373 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  42.23 
 
 
370 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  39.51 
 
 
371 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  40.97 
 
 
373 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  38.61 
 
 
373 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  38.87 
 
 
373 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.87 
 
 
373 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  41.49 
 
 
371 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  38.61 
 
 
373 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.34 
 
 
373 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  38.34 
 
 
373 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  38.34 
 
 
373 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  38.07 
 
 
373 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.34 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  38.07 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  39.57 
 
 
369 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  40.97 
 
 
373 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  42.58 
 
 
373 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  38.34 
 
 
388 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  39.04 
 
 
393 aa  246  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  37.6 
 
 
373 aa  245  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  39.47 
 
 
381 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  40.77 
 
 
373 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  32.88 
 
 
366 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  38.51 
 
 
395 aa  230  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 
369 aa  229  6e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  39.3 
 
 
377 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  36.26 
 
 
373 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  37.8 
 
 
380 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  37.72 
 
 
365 aa  219  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  32.88 
 
 
367 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  36.86 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  37.47 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  37.47 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  37.47 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  35.93 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  37.15 
 
 
384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  36.76 
 
 
366 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  32.09 
 
 
366 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  38.18 
 
 
374 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  39.17 
 
 
373 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  34.68 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  33.43 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  42.07 
 
 
361 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  35.95 
 
 
364 aa  199  5e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  31.89 
 
 
366 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  31.89 
 
 
366 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  31.41 
 
 
364 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  31.85 
 
 
364 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  31.07 
 
 
369 aa  176  5e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  27.58 
 
 
386 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  30 
 
 
319 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  39.53 
 
 
279 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  37.98 
 
 
307 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  36.8 
 
 
256 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  40 
 
 
310 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  28.94 
 
 
324 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  30.18 
 
 
344 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  37.19 
 
 
287 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  46.15 
 
 
262 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  39.06 
 
 
296 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  36.8 
 
 
264 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  38.4 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  35.38 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  35.16 
 
 
290 aa  97.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.59 
 
 
269 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  36.67 
 
 
278 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  37.3 
 
 
279 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  33.59 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  36.13 
 
 
268 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  43.81 
 
 
105 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  30.33 
 
 
274 aa  90.5  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  36.45 
 
 
262 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  35.71 
 
 
273 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  36.45 
 
 
262 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  25.29 
 
 
336 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  30.67 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  38.14 
 
 
259 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  39.2 
 
 
255 aa  87.4  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  41.18 
 
 
103 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  33.05 
 
 
255 aa  87.4  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  40.2 
 
 
105 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  40.2 
 
 
105 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  32.79 
 
 
261 aa  85.9  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  33.6 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.13 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>