222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5147 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 366 aa  754    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  61.75 
 
 		 366 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  55.99 
 
 		 365 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  50.41 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  54.14 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  51.66 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  49.45 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  50.83 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  51.49 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  43.53 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  40.27 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  44.18 
 
 		 371 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  41.21 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  41 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  40.11 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  40.11 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  40.11 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.38 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  40.11 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  42.78 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  40.93 
 
 		 373 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  39.84 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  39.84 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  37.47 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  40.65 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  38.9 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  36.71 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  39.01 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  40.18 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  38.19 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  38.82 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  36.78 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.53 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  34.69 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  37.21 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  38.14 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  36.86 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  36.89 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  34.6 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  36.1 
 
 		 388 aa  215  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  35.93 
 
 		 377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  37.58 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  33.42 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  33.42 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  37.27 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  36.23 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  35.63 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  33.43 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  33.24 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  33.42 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  35.33 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  36.31 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  33.24 
 
 		 373 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  32.75 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  36.61 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  38.1 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  33.63 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  34.12 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  34.12 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  34.12 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  37.05 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  37.46 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.64 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  31.23 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  43.41 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  41.32 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  39.2 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  38.1 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  28.57 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  38.4 
 
 		 290 aa  99.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  38.06 
 
 		 262 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  37.31 
 
 		 262 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  36.29 
 
 		 274 aa  94  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  25 
 
 		 319 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  46.32 
 
 		 103 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  39.02 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  26.11 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  30.67 
 
 		 310 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  39.62 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  34.43 
 
 		 278 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  32.54 
 
 		 279 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  90.1  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  38.52 
 
 		 262 aa  89.4  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  43.56 
 
 		 241 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  43.56 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  43.56 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  36.13 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  33.13 
 
 		 307 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3775  hypothetical protein  46.39 
 
 		 109 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.33032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  43.16 
 
 		 103 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  42.16 
 
 		 103 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  45.26 
 
 		 105 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  35.48 
 
 		 261 aa  86.7  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  45.54 
 
 		 240 aa  85.9  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  42.57 
 
 		 241 aa  85.9  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  40.2 
 
 		 103 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  32.54 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  45.26 
 
 		 103 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  42 
 
 		 107 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>