154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5270 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  100 
 
 
386 aa  784    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  31.14 
 
 
368 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  32.24 
 
 
373 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  30.53 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  27.39 
 
 
371 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  29.38 
 
 
371 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  31.49 
 
 
374 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  28.24 
 
 
388 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  30 
 
 
372 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  31.22 
 
 
369 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  32.02 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  28.86 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 
381 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  33.97 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  28.98 
 
 
373 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  28.88 
 
 
364 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  29.92 
 
 
373 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  29.72 
 
 
372 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  26.37 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  28.64 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  28.69 
 
 
373 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.41 
 
 
373 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  27.84 
 
 
373 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.84 
 
 
373 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  28.12 
 
 
373 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  29.06 
 
 
373 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  30.81 
 
 
364 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.84 
 
 
373 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  28.12 
 
 
373 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  27.84 
 
 
373 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  27.84 
 
 
373 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  27.84 
 
 
373 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  28.61 
 
 
367 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  28.39 
 
 
372 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  28.32 
 
 
372 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  32.88 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  28.18 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  26.87 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  27.69 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  30 
 
 
380 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  28.82 
 
 
366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  28.01 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  30.71 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  25.34 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  27.68 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  27.35 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  27.58 
 
 
377 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  30.05 
 
 
384 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  27.18 
 
 
369 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  31.72 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  31.67 
 
 
373 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  29.86 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  29.86 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  29.86 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  21.77 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  28.22 
 
 
374 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  29.95 
 
 
377 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  27.01 
 
 
379 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  28.73 
 
 
373 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  37.61 
 
 
264 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  38.94 
 
 
274 aa  93.6  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  27.57 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  30.98 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  21.84 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  21.84 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02550  conserved hypothetical protein  37.75 
 
 
293 aa  90.1  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.156372  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10437  NGG1 interacting factor Nif3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12480)  42.61 
 
 
370 aa  89.4  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0684928  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  36.67 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  32.2 
 
 
259 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  36.61 
 
 
274 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  34.19 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  31.36 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  40 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  40 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  31.5 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  39.83 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  34.71 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  32.5 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  34.17 
 
 
307 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  32.14 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  35.9 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  30.53 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  32.76 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  38.14 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  34.71 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  32.76 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  33.93 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.46 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  33.98 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  33.98 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  37.29 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  31.76 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.21 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  36.07 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  37.19 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  36.21 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  33.05 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>