100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3412 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3412  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.823966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39650  hypothetical protein  76.19 
 
 		 105 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  76.19 
 
 		 105 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  75.24 
 
 		 105 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  70.87 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  71.84 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  69.9 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  69.9 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1079  hypothetical protein  68.93 
 
 		 103 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4188  hypothetical protein  66.99 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  56.31 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  54.81 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1035  hypothetical protein  66.02 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  55.77 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0153  hypothetical protein  56.31 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296834  hitchhiker  0.0000244541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  55.34 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2437  hypothetical protein  55 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0085  hypothetical protein  51.46 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0205991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2583  hypothetical protein  54 
 
 		 104 aa  120  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2172  hypothetical protein  53 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0009  hypothetical protein  53 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0681  structural toxin protein RtxA  50.96 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  44.12 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3775  hypothetical protein  53.68 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.33032  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11154  conserved hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  43 
 
 		 371 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  45 
 
 		 379 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  44.9 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  44 
 
 		 371 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  40.59 
 
 		 379 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  40.59 
 
 		 379 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  40.59 
 
 		 379 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  45 
 
 		 375 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  42.16 
 
 		 371 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  41.18 
 
 		 373 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  41.18 
 
 		 373 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  39 
 
 		 368 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  39.22 
 
 		 373 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  39.22 
 
 		 373 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  43.69 
 
 		 379 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  41.18 
 
 		 373 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  42 
 
 		 373 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  44 
 
 		 372 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  39.22 
 
 		 373 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  39.22 
 
 		 373 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  39.22 
 
 		 373 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  44.21 
 
 		 374 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  38.24 
 
 		 373 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.24 
 
 		 373 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  39.22 
 
 		 374 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  37.25 
 
 		 367 aa  87  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  37.62 
 
 		 370 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  37.25 
 
 		 373 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  41.18 
 
 		 364 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  42.42 
 
 		 373 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  43.75 
 
 		 395 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.25 
 
 		 373 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  38.78 
 
 		 381 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  40 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  38.24 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.63 
 
 		 372 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  37.93 
 
 		 366 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  33.67 
 
 		 373 aa  80.5  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  38 
 
 		 377 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  34.31 
 
 		 364 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  34 
 
 		 366 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  35 
 
 		 365 aa  77.8  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  37.89 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  36.45 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  39 
 
 		 380 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  36 
 
 		 388 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  36.84 
 
 		 366 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  36.84 
 
 		 366 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  36 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0545  nitrogen regulatory protein PII  33.01 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  8.30947e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  44.12 
 
 		 377 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  35.79 
 
 		 366 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  33.66 
 
 		 369 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  37.08 
 
 		 373 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  41.84 
 
 		 384 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2423  hypothetical protein  34.41 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.36164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  35 
 
 		 364 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2690  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000001361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2452  cutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00490395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  32.63 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  43.66 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2741  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.26 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000239405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2713  divalent cations, tolerance CutA family protein  31.18 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2612  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.849435  hitchhiker  0.00000461322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2698  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0556  hypothetical protein  43.56 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  30.39 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  42.25 
 
 		 372 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  39 
 
 		 393 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  38.78 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  41.94 
 
 		 373 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02240  hypothetical protein  40.86 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.04 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>