219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2043 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  747    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  43.96 
 
 
364 aa  341  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  46.13 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  41.83 
 
 
367 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  43.53 
 
 
366 aa  322  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  43.41 
 
 
365 aa  322  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  42.31 
 
 
364 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  41.05 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  40.93 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  39.89 
 
 
369 aa  291  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  39.71 
 
 
371 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  37.53 
 
 
381 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  36.99 
 
 
369 aa  228  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  37.04 
 
 
372 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  35.25 
 
 
373 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  35.86 
 
 
374 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  34.97 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  34.7 
 
 
373 aa  222  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.7 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.7 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  34.7 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  34.7 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  33.7 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  34.7 
 
 
373 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  34.7 
 
 
373 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.08 
 
 
373 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  37.76 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  35.44 
 
 
373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  35.65 
 
 
371 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  36.86 
 
 
388 aa  209  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.07 
 
 
372 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  33.88 
 
 
373 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  33.7 
 
 
373 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  29.92 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  33.51 
 
 
366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  31.74 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  35.95 
 
 
377 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  35.63 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  34.83 
 
 
375 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  33.97 
 
 
373 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  33.63 
 
 
373 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 
388 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  33.83 
 
 
372 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  35.8 
 
 
380 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  34.73 
 
 
372 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  32.76 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  32.81 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  35.76 
 
 
384 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  30.35 
 
 
366 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  30.35 
 
 
366 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  32.04 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  37.58 
 
 
361 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  32.11 
 
 
395 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  30.69 
 
 
379 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  30.69 
 
 
379 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  30.69 
 
 
379 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  32.35 
 
 
373 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  31.47 
 
 
373 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  32.05 
 
 
379 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  31.65 
 
 
377 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  30.03 
 
 
374 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  31.04 
 
 
379 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  30.81 
 
 
386 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  26.7 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  41.67 
 
 
262 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.5 
 
 
269 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  35.82 
 
 
264 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  45.54 
 
 
106 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  37.67 
 
 
256 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  35.85 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  37.8 
 
 
261 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  39.42 
 
 
107 aa  92.8  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.07 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  37.01 
 
 
287 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  27.73 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  35.48 
 
 
279 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  35.94 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  25.07 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  32.28 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  26.81 
 
 
324 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  39.55 
 
 
263 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  34.62 
 
 
257 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  38.93 
 
 
263 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  30.7 
 
 
255 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  36.79 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0681  structural toxin protein RtxA  36 
 
 
118 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280515  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  41.18 
 
 
103 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  36.79 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  39.18 
 
 
108 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  32 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  36.22 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  33.87 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  37.25 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  35.94 
 
 
264 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  35.16 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  39.06 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  40.2 
 
 
105 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  31.71 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>