162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1436 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  44.32 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  40.48 
 
 		 286 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  40.53 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  76.64 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  38.32 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  64 
 
 		 279 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  37.64 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  58.27 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  60.48 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  34.29 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  61.02 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  61.02 
 
 		 278 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  28.65 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  28.65 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  58.59 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.65 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  29.73 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  27.57 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  56.25 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.92 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  29.19 
 
 		 366 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  29.19 
 
 		 366 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  60.16 
 
 		 395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  58.27 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  60.16 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  53.73 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  59.17 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  52.98 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  53.38 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  26.74 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  53.54 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  54.55 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  30.67 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  26.32 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  57.03 
 
 		 273 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  26.03 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  27.42 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  30.35 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  27.47 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  31.72 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  50.38 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  51.49 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  51.09 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  52.76 
 
 		 287 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  29.64 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  44.08 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  29.46 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  25.33 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  48.06 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  47.37 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  47.37 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  47.37 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  22.7 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  25.9 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  47.76 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  44.35 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  47.52 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  35.55 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  23.53 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  35.43 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  25.37 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  41.35 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  37.4 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  40 
 
 		 371 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  35.77 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  34.96 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  36.07 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.77 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  34.96 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  39.83 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  37.01 
 
 		 372 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  37.78 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  39.52 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.14 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  31.13 
 
 		 264 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  48.53 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  41.18 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  35.04 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  34.68 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  34.4 
 
 		 265 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  38.89 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  28.08 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  36.72 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  40.5 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  35.48 
 
 		 262 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  35.29 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  33.61 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  35.48 
 
 		 262 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  29.25 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.96 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  32.56 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  29.46 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  42.5 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  35.25 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  34.96 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  34.96 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  33.87 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  37.5 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>