258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1125 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  746    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  63.56 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  63.56 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  38.46 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  38.46 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  38.46 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.46 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.67 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  38.19 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.19 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  37.91 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  37.91 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  37.91 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  34.15 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  34.24 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  34.89 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  36.59 
 
 		 371 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  35.05 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  38.19 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  33.6 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  34.25 
 
 		 371 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  36.61 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  35.5 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  33.42 
 
 		 388 aa  232  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  32.88 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  34.34 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  32.61 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  34.7 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  32.34 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  33.06 
 
 		 370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  31.79 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  32.35 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  34.24 
 
 		 364 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  34.6 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  35.05 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  33.88 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.07 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  31.32 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  33.97 
 
 		 365 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  31.62 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  32.97 
 
 		 364 aa  205  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  35 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  32.02 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  29.92 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  34.78 
 
 		 364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  31.03 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  31.6 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  30.27 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  31.71 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  29.08 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  28.98 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  30.24 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  30.91 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  26.98 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  27.49 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  26.61 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  26.61 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  26.61 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  27.72 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  27.08 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  28.44 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  21.77 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  22.38 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  25.53 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  24.64 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  40.5 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  24.71 
 
 		 324 aa  99.8  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  40.15 
 
 		 262 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  48.54 
 
 		 274 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 256 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  32 
 
 		 264 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  23.85 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  33.05 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  32.28 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  31.34 
 
 		 255 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  38.66 
 
 		 259 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  27.69 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.05 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  30.71 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  35.83 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.5 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  43.27 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  35.2 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  45.19 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  38.14 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  31.62 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  35.35 
 
 		 105 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  35.79 
 
 		 103 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  37.29 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  35.35 
 
 		 103 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  39.05 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  31.31 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  34.19 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  29.92 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>