295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2674 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 369 aa  754    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  38.67 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  44.48 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  39.19 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  38.44 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  38.04 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  40.38 
 
 		 381 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  35.73 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  37.68 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  40.38 
 
 		 393 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  37.1 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  36.44 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.25 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  34.77 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  36.31 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  34.5 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  34.5 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.5 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  34.5 
 
 		 373 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  34.5 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.5 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  34.49 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  36.22 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  36.99 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  33.96 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  37.1 
 
 		 372 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.69 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  33.42 
 
 		 373 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  36.02 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  33.7 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  34.3 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  32.78 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  35.38 
 
 		 373 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  37.57 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  33.97 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  31.62 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  33.24 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  33.42 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  32.35 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  34.72 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  32.71 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  32.96 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  39.54 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  37.96 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  32.97 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  31.04 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  31.17 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  35.42 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  36.96 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  35.91 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  35.6 
 
 		 374 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  31.64 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  35.36 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  35.51 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  35.51 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  35.51 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  34.94 
 
 		 379 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  29.83 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  29.83 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  30.43 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  37.18 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  31.22 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  52.53 
 
 		 106 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  48.48 
 
 		 105 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  44.17 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  32.03 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  39.2 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  38.71 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  38.28 
 
 		 264 aa  96.3  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  36.72 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  24.72 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  34.56 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.1 
 
 		 269 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  38.24 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  36.15 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  41.41 
 
 		 103 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  32.48 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  37.19 
 
 		 255 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  39.81 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  36.69 
 
 		 273 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  28.65 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  39.81 
 
 		 262 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  35.43 
 
 		 290 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  40.82 
 
 		 103 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  37.21 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  43.62 
 
 		 103 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  36 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  39.8 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  37.1 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  34.92 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  37.9 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  43.43 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  29.71 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0153  hypothetical protein  40.62 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296834  hitchhiker  0.0000244541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  37.37 
 
 		 103 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  39.13 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11154  conserved hypothetical protein  44.23 
 
 		 112 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221049 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  34.15 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>