159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1948 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  100 
 
 
319 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  43.17 
 
 
324 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  39.26 
 
 
336 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  42.55 
 
 
344 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  38.41 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  30.98 
 
 
371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  50 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  28.53 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  29.52 
 
 
370 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  31.19 
 
 
279 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  27.48 
 
 
371 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  31.51 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  28.41 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  29.48 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  31.03 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  30.6 
 
 
372 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.3 
 
 
373 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  26.59 
 
 
373 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  26.59 
 
 
373 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  27.98 
 
 
368 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.3 
 
 
373 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  26.01 
 
 
373 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  26.51 
 
 
373 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  26.3 
 
 
373 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  30.58 
 
 
372 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  27.3 
 
 
373 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  30.89 
 
 
372 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.3 
 
 
373 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  24.64 
 
 
366 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  28.57 
 
 
374 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  26.01 
 
 
373 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  26.22 
 
 
373 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  26.07 
 
 
373 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  28.1 
 
 
372 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.71 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  27.88 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  23.84 
 
 
366 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  23.84 
 
 
366 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  25 
 
 
366 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  26.96 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  26.48 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  39.02 
 
 
373 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  28.4 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  26.69 
 
 
256 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  26.5 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  22.75 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  26.12 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  23.39 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  22.99 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  23.19 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  24.63 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  24 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  25.54 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  34.4 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  34.4 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  34.17 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  22.88 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  27.59 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  34.92 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  25.42 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  21.54 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  25.61 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  31.2 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  23.75 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  27.6 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  25.65 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  41.58 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  32.52 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  27.04 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  32.26 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  21.97 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  30.08 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  29.46 
 
 
249 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  25.15 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  27.47 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  20.06 
 
 
255 aa  63.2  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  29.92 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  24.85 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  25.42 
 
 
265 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  25.07 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  21.92 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  35.64 
 
 
241 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  35.64 
 
 
241 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  24.46 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  28.1 
 
 
273 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  36.13 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  31.9 
 
 
395 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  31.78 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  26.19 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  30.58 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  32.5 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  33.62 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  25.83 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  25 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  25.83 
 
 
386 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>