188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0444 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  54.81 
 
 
239 aa  287  9e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  50.21 
 
 
240 aa  255  4e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  51.67 
 
 
241 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  50.83 
 
 
241 aa  250  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  50.83 
 
 
241 aa  250  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  50.83 
 
 
241 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  48.12 
 
 
240 aa  247  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  49.59 
 
 
242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  47.7 
 
 
240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  30.6 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  30.04 
 
 
259 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  30.51 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  31.14 
 
 
256 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  31.25 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  29.32 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  29.26 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  28.81 
 
 
296 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  31.3 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  27.45 
 
 
263 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  27 
 
 
262 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  27 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  25.84 
 
 
290 aa  88.6  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  23.55 
 
 
269 aa  89  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  31.88 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  25.2 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  26.51 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  38.33 
 
 
365 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.41 
 
 
309 aa  86.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  28.18 
 
 
294 aa  86.3  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  26.91 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  27.2 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  35.54 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  24.37 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  24.12 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  35.85 
 
 
364 aa  82  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  36.27 
 
 
366 aa  81.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  26.53 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  28.63 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  29.92 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  35.19 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  25.81 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  36.27 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  35.59 
 
 
371 aa  79  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  22.88 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl272  hypothetical protein  24.8 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000472671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  26.52 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  22.14 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  36.29 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  37.86 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  36.29 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  24.82 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  24.59 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  33.63 
 
 
371 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  22.73 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  36.89 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  25.35 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  32.71 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  33.06 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  23.85 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  36.21 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  25.49 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  35.29 
 
 
375 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  30.3 
 
 
388 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  25.64 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  32.52 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  35.29 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  35.92 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  23.3 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  24.5 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  33.98 
 
 
369 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  34.96 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  28.46 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  27.66 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.33 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  30.17 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  24.82 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0358  NIF3 family protein  26.16 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0554308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  22.88 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  27.73 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  33.87 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  23.76 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  30.25 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0501  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00505671  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02550  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.156372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  27.88 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  20.96 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  26.21 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  31.68 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  22.67 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06950  hypothetical protein  22 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.651716 
 
 
-
 
NC_002620  TC0384  hypothetical protein  24.71 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  36.24 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  28.03 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  32.04 
 
 
364 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  24.89 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  29.46 
 
 
366 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  32.17 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>