271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0747 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  566  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  45.72 
 
 
261 aa  258  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  43.87 
 
 
265 aa  240  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  41.85 
 
 
262 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  40 
 
 
262 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  35.85 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  36.03 
 
 
262 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  32.52 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  34.5 
 
 
264 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  38.86 
 
 
263 aa  143  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  38.2 
 
 
286 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  36.12 
 
 
256 aa  142  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  32.2 
 
 
286 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  31.89 
 
 
262 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  37.5 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  31.89 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  35.32 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  37.96 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.01 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  32.87 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  32.75 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  34.72 
 
 
290 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  31.69 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  36.64 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  32.14 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  32.74 
 
 
278 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  34.82 
 
 
307 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  32.9 
 
 
279 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  46.97 
 
 
373 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  43.61 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  33.47 
 
 
287 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  30.45 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  27.9 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.63 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  40.91 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.39 
 
 
287 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02550  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
293 aa  112  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.156372  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  30.14 
 
 
274 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  44 
 
 
373 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  44 
 
 
373 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  44 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  44 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  44 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  44 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  44 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  44 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  44 
 
 
373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  44.8 
 
 
373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  29.55 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  32.4 
 
 
275 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  41.67 
 
 
368 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  38.52 
 
 
372 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  32.47 
 
 
264 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  38.52 
 
 
375 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  41.94 
 
 
370 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  42.15 
 
 
369 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  33.5 
 
 
294 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  41.6 
 
 
373 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  29.78 
 
 
255 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  27.88 
 
 
294 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  41.67 
 
 
373 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  37.3 
 
 
374 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  39.67 
 
 
371 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.17 
 
 
309 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  36.72 
 
 
395 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  41.94 
 
 
366 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  38.71 
 
 
369 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  34.62 
 
 
372 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  36.67 
 
 
372 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  48.54 
 
 
366 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  37.5 
 
 
372 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  30.67 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  36.29 
 
 
366 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  30.8 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  27.17 
 
 
249 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  35.38 
 
 
373 aa  92.4  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  30.42 
 
 
254 aa  92.4  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  31.25 
 
 
246 aa  92  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.46 
 
 
373 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  26.48 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  30.33 
 
 
377 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  30.21 
 
 
246 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  35.83 
 
 
381 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  30.3 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  35.66 
 
 
380 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  35.04 
 
 
388 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  35.34 
 
 
371 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  40.62 
 
 
361 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  29.7 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  29.87 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  37.1 
 
 
367 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  27.31 
 
 
240 aa  87  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  31.15 
 
 
366 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  33.87 
 
 
346 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  37.39 
 
 
364 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  30.52 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  36.61 
 
 
386 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  28.14 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  30.83 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  28.45 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>