120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0501 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0501  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00505671  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl272  hypothetical protein  48.25 
 
 
258 aa  211  7e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000472671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  33.6 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  29.46 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  25.86 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  24.4 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  27.85 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  31.13 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  30.56 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  28.22 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0358  NIF3 family protein  26.27 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0554308  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  31.58 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  25.49 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  19.92 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  29.46 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  25.86 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  30.77 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  31.45 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  25.82 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  26.52 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  26.05 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  19.25 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  26.77 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  30.48 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  31.73 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  30.77 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  20.63 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  23.08 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  22.35 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  30.84 
 
 
374 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  27.08 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  31.82 
 
 
368 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  24.39 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  23.75 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  29.25 
 
 
386 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  20.18 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  29.41 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  34.62 
 
 
373 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  24.53 
 
 
380 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  17.06 
 
 
287 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  19.42 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  28.93 
 
 
372 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  31.93 
 
 
373 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  30.77 
 
 
381 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.67 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  31.09 
 
 
371 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  17.89 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  29.75 
 
 
367 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  26.52 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  23.02 
 
 
393 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  23.02 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  32.69 
 
 
366 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  33.71 
 
 
372 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  33.94 
 
 
364 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  20.83 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  18.42 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  34.83 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  17.8 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  18.56 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  31.91 
 
 
373 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  25.58 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  19.25 
 
 
310 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.56 
 
 
372 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  32.04 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  24.51 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  25.24 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  32.04 
 
 
373 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  21.43 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  32.04 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  32.04 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  32.04 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  25.41 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  20.33 
 
 
395 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.04 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.04 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.04 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  32.67 
 
 
373 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  17.12 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  19.68 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  32.67 
 
 
373 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  26.42 
 
 
373 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  22.52 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02550  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.156372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  24.39 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  16.4 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  24.04 
 
 
388 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  27.78 
 
 
388 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  26.47 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  29.25 
 
 
365 aa  49.3  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  21.43 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  23.3 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  21 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  19.53 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  30.91 
 
 
366 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0818  hypothetical protein  20.78 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402341  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  24.67 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  29.25 
 
 
366 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  29.25 
 
 
366 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>