149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5076 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  57.19 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  53.87 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  46.23 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  50.17 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  49.65 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  51.39 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  45.33 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  50.85 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  53.12 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  50.17 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  49.33 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  47.9 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  51.19 
 
 		 275 aa  205  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  45.64 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  47.18 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  47.12 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  43.49 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  45.21 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.23 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  76.64 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  43.3 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  45.42 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  64.52 
 
 		 393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  37.17 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  35.74 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  56.92 
 
 		 380 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  28.52 
 
 		 262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  28.15 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  28.05 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  53.52 
 
 		 384 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  57.6 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  30.04 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  33.22 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  51.13 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  29.27 
 
 		 259 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  47.76 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  49.62 
 
 		 379 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  49.62 
 
 		 379 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  49.62 
 
 		 379 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  29.89 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  48.61 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  28.47 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  48.51 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  29.08 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  34.38 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  52.07 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  28.07 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  25.2 
 
 		 255 aa  99.4  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  42.19 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  28.63 
 
 		 263 aa  96.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  37.7 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  50 
 
 		 379 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  37.7 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  36.89 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  36.89 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  36.07 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  36.89 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.89 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.89 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  34.43 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.89 
 
 		 373 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  36.89 
 
 		 373 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.34 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 		 388 aa  90.1  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  41.67 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  31.78 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  28.96 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  20.39 
 
 		 241 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  32.52 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  37.6 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  39.68 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  21.18 
 
 		 241 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  21.31 
 
 		 241 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  38.14 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  31.74 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  24.21 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  36.59 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  36.72 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  34.96 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  28.69 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  26.01 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  35.66 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  38.33 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  38.33 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  26.64 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  38.76 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.61 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  39.67 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  36.51 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  39.32 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  36.75 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  35.04 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  20.82 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  37.4 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  24.91 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  25.38 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>