287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2261 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  98.85 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  41.89 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  35.5 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  34.57 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  41.48 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  33.09 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  33.82 
 
 		 310 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  34.66 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  36.5 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  35.02 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  32.79 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  31.48 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  32.32 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  35.43 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.42 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  31.2 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  31.94 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  32.07 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  29.82 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  32.52 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  34.98 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  30.4 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  31.72 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  34.22 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  29.6 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  31.18 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  30.49 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  31.32 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  31.72 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  31.2 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.15 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  32.96 
 
 		 246 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  28.26 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  30.15 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  32.71 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  31.34 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  26.74 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  32.7 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  31.15 
 
 		 240 aa  116  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  29.6 
 
 		 263 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  32.21 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  43.65 
 
 		 371 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  32.44 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  31.68 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  27.3 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  28.76 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02550  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.156372  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  31.56 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  43.7 
 
 		 368 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  37.96 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  43.33 
 
 		 373 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  44.44 
 
 		 373 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  31.5 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  41.22 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  40.68 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  44.07 
 
 		 381 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  44.44 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  44.44 
 
 		 373 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  44.44 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  44.44 
 
 		 373 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  44.44 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  44.44 
 
 		 373 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  30.3 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  44.44 
 
 		 373 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  44.74 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  32.34 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  43.59 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  37.14 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  34.35 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  43.59 
 
 		 371 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  32.07 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  42.15 
 
 		 373 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  44.83 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  27.65 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  29.28 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  28.28 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  30.13 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  39.5 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  32.97 
 
 		 388 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  36.97 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  29.28 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  27 
 
 		 240 aa  99  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  35.77 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  35.86 
 
 		 366 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  32.09 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  40 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  40.8 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  41.18 
 
 		 372 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  37.3 
 
 		 364 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  34.96 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  38.66 
 
 		 371 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  35.61 
 
 		 395 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  41.38 
 
 		 375 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  36.43 
 
 		 365 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  43.1 
 
 		 373 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  37.82 
 
 		 364 aa  95.1  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  38.14 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  29.33 
 
 		 373 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>