253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2410 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  100 
 
 
373 aa  760    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  72.92 
 
 
373 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  70.24 
 
 
373 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  69.71 
 
 
373 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  69.97 
 
 
373 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  69.97 
 
 
373 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  69.44 
 
 
373 aa  544  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  69.71 
 
 
373 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  69.17 
 
 
373 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  68.9 
 
 
373 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  68.1 
 
 
373 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  67.83 
 
 
373 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  67.02 
 
 
373 aa  518  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  48.25 
 
 
371 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  48.36 
 
 
369 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  49.46 
 
 
373 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  45.21 
 
 
368 aa  325  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  45.21 
 
 
371 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  47.26 
 
 
371 aa  315  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  45.36 
 
 
372 aa  315  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  44.63 
 
 
370 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  44.69 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  43.09 
 
 
372 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  43.09 
 
 
375 aa  292  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  41.78 
 
 
372 aa  289  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  40.43 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  40.97 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  39.35 
 
 
388 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  41.46 
 
 
381 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  40.53 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  39.3 
 
 
372 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  38.71 
 
 
367 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  38.9 
 
 
366 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  39.02 
 
 
372 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  44.23 
 
 
365 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  45.18 
 
 
361 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  34.89 
 
 
366 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  41.42 
 
 
366 aa  246  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  37.67 
 
 
364 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  38.17 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  40.8 
 
 
373 aa  237  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  34.49 
 
 
369 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  37.6 
 
 
365 aa  229  6e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  40.18 
 
 
364 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  38.21 
 
 
374 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  36.31 
 
 
366 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  36.51 
 
 
380 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  37.58 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  36.89 
 
 
364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  37.33 
 
 
373 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  34.25 
 
 
366 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  34.25 
 
 
366 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  36.93 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  36.93 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  36.93 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  39.18 
 
 
384 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  38.84 
 
 
379 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  33.88 
 
 
364 aa  206  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  39.1 
 
 
377 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  37.94 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  35.33 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  31.73 
 
 
369 aa  176  7e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.98 
 
 
386 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  48.84 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  43.61 
 
 
274 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  44.44 
 
 
262 aa  123  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  36.22 
 
 
262 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  54.55 
 
 
106 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  27.19 
 
 
330 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  29.48 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  40 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  42.15 
 
 
257 aa  111  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  44.96 
 
 
262 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  42.02 
 
 
255 aa  108  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  46.08 
 
 
103 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  43.14 
 
 
103 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  45.92 
 
 
105 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  39.19 
 
 
256 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  45.38 
 
 
246 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  44 
 
 
103 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  40.91 
 
 
246 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  41.75 
 
 
108 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  44.8 
 
 
254 aa  96.7  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  44.12 
 
 
246 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  37.01 
 
 
290 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  26.89 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  28.05 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  43.44 
 
 
246 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  34.85 
 
 
296 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2437  hypothetical protein  44 
 
 
104 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  43 
 
 
107 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3775  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.33032  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  39.02 
 
 
264 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.4 
 
 
269 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  40.2 
 
 
105 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  40.2 
 
 
105 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.85 
 
 
287 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>