275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0544 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 264 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  42.06 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  41.67 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  39.46 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  35.77 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  32.97 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  35.14 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  32.5 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  34.33 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  32.72 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  34.96 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.7 
 
 		 269 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  34.13 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  32.6 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  33.6 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  32.35 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  33.21 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  35.47 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  30.5 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  31.09 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  52.38 
 
 		 368 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  33.58 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  33.91 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  33.21 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  33.05 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  28.3 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  34.08 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.65 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  30.38 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  30.88 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  31.43 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  26.55 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  30.86 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  29.6 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  29.66 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  32.21 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  30.83 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  28.51 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  29.55 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  31.68 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  30.89 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  29.66 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  30.56 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  32.74 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  47.15 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  30.33 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  34.16 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  28.14 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  43.65 
 
 		 373 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  43.65 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  43.65 
 
 		 373 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.65 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  44.8 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  43.65 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.65 
 
 		 373 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.05 
 
 		 309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  43.65 
 
 		 373 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.65 
 
 		 373 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  29.09 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  42.52 
 
 		 373 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  34.44 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  27 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  42.86 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  43.65 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  29.84 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  45.69 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  39.69 
 
 		 367 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  41.94 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  40 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  31.82 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  40.48 
 
 		 370 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  35.37 
 
 		 374 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  42.98 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  31.06 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  39.2 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  39.2 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  38.71 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  39.83 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  40.5 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  35.34 
 
 		 380 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  28.06 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  40.65 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.12 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  40.16 
 
 		 364 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  37.1 
 
 		 377 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02550  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.156372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  43.9 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  35.82 
 
 		 364 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  25.84 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  39.55 
 
 		 372 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  38.28 
 
 		 369 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  36.8 
 
 		 373 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  38.84 
 
 		 366 aa  95.5  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  38.84 
 
 		 366 aa  95.5  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  37.4 
 
 		 393 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  37.61 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  38.58 
 
 		 364 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  39.02 
 
 		 373 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  29.36 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>