284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2459 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  761    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  58.15 
 
 
373 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  48.63 
 
 
370 aa  361  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  48.37 
 
 
368 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  47.67 
 
 
371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  48.25 
 
 
373 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  48.25 
 
 
373 aa  348  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  47.71 
 
 
373 aa  348  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  47.98 
 
 
373 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  47.71 
 
 
373 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  47.98 
 
 
373 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  47.98 
 
 
373 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  47.98 
 
 
373 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  47.49 
 
 
371 aa  345  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  47.44 
 
 
373 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  47.98 
 
 
373 aa  344  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  48.25 
 
 
373 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  47.15 
 
 
373 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  47.27 
 
 
373 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  46.09 
 
 
372 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  43.05 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  42.74 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  41.64 
 
 
375 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  39.94 
 
 
372 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  42.77 
 
 
369 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  43.58 
 
 
366 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  39.51 
 
 
377 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  39.08 
 
 
373 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  44.18 
 
 
366 aa  275  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  38.29 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  44.51 
 
 
381 aa  272  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  40.32 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  40.32 
 
 
372 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  38.44 
 
 
366 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  38.92 
 
 
367 aa  263  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  41.1 
 
 
365 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  41.33 
 
 
373 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  39.32 
 
 
388 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  38.81 
 
 
393 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  39.71 
 
 
364 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  37.1 
 
 
380 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  39.36 
 
 
364 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  37.06 
 
 
365 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  37.2 
 
 
395 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  35.23 
 
 
364 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  36.44 
 
 
369 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  34.25 
 
 
366 aa  235  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  43.39 
 
 
361 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  39.78 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  39.07 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  40.59 
 
 
374 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  39.94 
 
 
373 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  35.69 
 
 
364 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  38.56 
 
 
377 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  37.24 
 
 
379 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  37.24 
 
 
379 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  37.24 
 
 
379 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  39.04 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 
384 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  34.39 
 
 
369 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  34.43 
 
 
366 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  34.43 
 
 
366 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  29.38 
 
 
386 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  54.4 
 
 
262 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  30.98 
 
 
319 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  29.94 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  47.15 
 
 
264 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  40.91 
 
 
274 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  43.85 
 
 
261 aa  116  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  43.65 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.73 
 
 
269 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  29.48 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  51.96 
 
 
106 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  52.08 
 
 
105 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  43.8 
 
 
255 aa  110  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  51 
 
 
103 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  41.22 
 
 
290 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  41.27 
 
 
290 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  41.09 
 
 
310 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  42.57 
 
 
108 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  28.41 
 
 
336 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  38.64 
 
 
286 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  41.94 
 
 
307 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  45.92 
 
 
103 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  40.15 
 
 
286 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  27.32 
 
 
324 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  40 
 
 
346 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  38.98 
 
 
287 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  41.13 
 
 
265 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  40.6 
 
 
273 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  35.71 
 
 
279 aa  99.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.67 
 
 
287 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  41.67 
 
 
278 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  47 
 
 
103 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  37.04 
 
 
279 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  40.16 
 
 
278 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  35.43 
 
 
296 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.27 
 
 
318 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39650  hypothetical protein  41.18 
 
 
105 aa  95.9  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>