189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1623 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  52.66 
 
 		 344 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  46.2 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  42.81 
 
 		 264 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  40.49 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  40.49 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  28.07 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  25.63 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  22.95 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  29.03 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  25.71 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  27.63 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  25.85 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  27.98 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  26.67 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  27.87 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.67 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  25.91 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  27.16 
 
 		 374 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  26.3 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  25.8 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  26.72 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  26.82 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  27.97 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  26 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  25.82 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  27.5 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  24.64 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  26.88 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  23.48 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  21.53 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  24.44 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  28.41 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  23.06 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  22.43 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  25.23 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  27.68 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  24.72 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  22.99 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  28.05 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  20.74 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  20.74 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  24.79 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  24.1 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  29.01 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  31.78 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  21.61 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  32.56 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  26.56 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  31.01 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  31.01 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.01 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  31.01 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.01 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  31.21 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  37.96 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2208  hypothetical protein  23.2 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  23.61 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  26.73 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  30.71 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  28.36 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  21.02 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  34.91 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  25.41 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  28.46 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.54 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  36.11 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  35.82 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  23.96 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  36.11 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.57 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.96 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  23.82 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  25.91 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  31.25 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  32.79 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  39.78 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  37.6 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  25.84 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  32.33 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  21.92 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  32.79 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  24.68 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  26.67 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  24.85 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  36.7 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  27.82 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  27.34 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  27.34 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  29.37 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  32.41 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  25.71 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  34.82 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  30.89 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>