219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0259 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 344 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  52.66 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  44.04 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  42.55 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  40.3 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  52.03 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  30.35 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  29.48 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  28.45 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  30.18 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  28.81 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  29.77 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  26.01 
 
 		 373 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.11 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  28.61 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  26.8 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  29.11 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  28.96 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  27 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  27 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  27 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  27 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.27 
 
 		 373 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  26.27 
 
 		 373 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  28.26 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  25.52 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  24.8 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  25.89 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  27.71 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  27.27 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  29.65 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  29.36 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  27.09 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  24.73 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  28.41 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  23.85 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  24.63 
 
 		 373 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  27.14 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  28.37 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  25.21 
 
 		 367 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  23.12 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  27.14 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  22.86 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  22.86 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  38.79 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  28.85 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  27.33 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  26.85 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  32.8 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  22.81 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  40.5 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  32.52 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  40.5 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  35.4 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  31.97 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  22.09 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  26.4 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  24.5 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  38.84 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  45.45 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  38.84 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  22.51 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  34.88 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  37.19 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  37.19 
 
 		 252 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  31.75 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  37.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  43.36 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  26.35 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  33.09 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  32.54 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  40 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  28.68 
 
 		 264 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2208  hypothetical protein  24 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  30.25 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  41.94 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  28.01 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  31.78 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  27.25 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  30.95 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  24.65 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  31.45 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  43.21 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  29.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  32.58 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  37.27 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  30.89 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  31.62 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  31.93 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  32.48 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  39.82 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2923  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  34.04 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  37.69 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.14 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  37.4 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  34.92 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  35.94 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>