260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4547 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  96.43 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  97.22 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  94.05 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  86.51 
 
 		 252 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  86.51 
 
 		 252 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  86.9 
 
 		 252 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  82.54 
 
 		 252 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  80.88 
 
 		 252 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  80.88 
 
 		 252 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  72.62 
 
 		 252 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  57.83 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  56.57 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3208  protein of unknown function DUF34  56.45 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  56.07 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  58.4 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  55.46 
 
 		 248 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  55.46 
 
 		 248 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  55.46 
 
 		 248 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  57.98 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  57.98 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  57.98 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  57.98 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  59 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  53.85 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  53.04 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  56.75 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  53.85 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  53.85 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  56.22 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  56.22 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  56.22 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  56.22 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  56.22 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  56.22 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  56.22 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  55.04 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  53.62 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  55.82 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  52.63 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  55.82 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  52.63 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  52.63 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  52.63 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  52.63 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  52.63 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  52.63 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  53.39 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  52.12 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  52.34 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  50.19 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  55.47 
 
 		 249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2861  protein of unknown function DUF34  56.85 
 
 		 248 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0748  protein of unknown function DUF34  52 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  53.39 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  56.49 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  55.42 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2931  hypothetical protein  53.23 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  55.02 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0413  hypothetical protein  51.27 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2050  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000274471  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  48.02 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  51.91 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3095  hypothetical protein  54.8 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.486394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1892  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.339977  hitchhiker  0.0000115783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  50.63 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  51.05 
 
 		 250 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0262  hypothetical protein  51 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000334154  hitchhiker  0.00500973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  51.46 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  52.26 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  51.85 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  51.85 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  50.21 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  54.39 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  54.39 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  54.39 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  51.85 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  50.4 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1914  hypothetical protein  51 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  50.62 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  53.97 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  50.21 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  47.18 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  51.03 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0806  hypothetical protein  50.79 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.554338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1135  protein of unknown function DUF34  52.92 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.573001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  46.86 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2073  hypothetical protein  48.76 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0879  hypothetical protein  46.44 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2923  protein of unknown function DUF34  56.25 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2212  hypothetical protein  53.63 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  47.3 
 
 		 260 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1604  hypothetical protein  53.36 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  53.78 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1581  hypothetical protein  46.96 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  51.9 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0096  hypothetical protein  48.21 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.387334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  47.01 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>