236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1729 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  44.44 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  44.04 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  38.41 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  35.87 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  27.07 
 
 		 368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  29.94 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  48.51 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  31.23 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  29.19 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  30.12 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  31.3 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  31.17 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.93 
 
 		 373 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  30.35 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  28.21 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  27.93 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  28.21 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.21 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  28.27 
 
 		 373 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  27.93 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  27.93 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  28.99 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  27.93 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.98 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  28.27 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  28.99 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  27.98 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  28.74 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  27.19 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  28.87 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  29.07 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  25.53 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  28.49 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  26.7 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  27.22 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  30.65 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  28.61 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  26.39 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  29.38 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  27.45 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  28.41 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  26.65 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  27.81 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.38 
 
 		 372 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  24.87 
 
 		 388 aa  95.9  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  24.7 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  24.7 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  24.78 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  25.95 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  24.64 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  27.18 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  38.89 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  26.79 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  24.1 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  26.44 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  24.61 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  28.35 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  25.7 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  33.86 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  27.22 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  25 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  24.14 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  37.3 
 
 		 246 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  33.61 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  36.07 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  35.83 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  24.91 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  36.51 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  37.19 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  27.91 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  39.42 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  32.26 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  35.2 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  26.49 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  27.94 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  25.72 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  30.53 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.72 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  30.71 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  29.13 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  31.29 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  32.54 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  27.5 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  25.4 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  23.43 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  29.69 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  28.45 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  33.06 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2208  hypothetical protein  36.19 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  28.47 
 
 		 384 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  30.71 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  31.01 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  28.3 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  28.46 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  33.07 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  22.76 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>