255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0892 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  48.37 
 
 		 371 aa  361  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  49.18 
 
 		 370 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  46.9 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  49.2 
 
 		 373 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  46.2 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  45.21 
 
 		 373 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  45.21 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  44.93 
 
 		 373 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  44.93 
 
 		 373 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  44.93 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  44.93 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  44.93 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  44.59 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  45.21 
 
 		 373 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  44.66 
 
 		 373 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  44.66 
 
 		 373 aa  317  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  42.32 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  44.38 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  43.51 
 
 		 375 aa  309  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  43.84 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  44.17 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  41.62 
 
 		 374 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  40.49 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  39.4 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  38.67 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  40.49 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  39.57 
 
 		 377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  37.94 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  40.05 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  40.72 
 
 		 365 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  36.56 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  36.29 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  39.66 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  37.47 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  36.72 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  37.26 
 
 		 366 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  38.73 
 
 		 366 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  35.92 
 
 		 373 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  37.85 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  35.34 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  36.89 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  35.97 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  33.88 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  35.5 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  35.89 
 
 		 364 aa  233  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  38.62 
 
 		 373 aa  229  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  35.95 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  35.95 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  33.7 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  38.4 
 
 		 361 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  36.44 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  35.03 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  34.41 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  32.7 
 
 		 373 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  31.18 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  31.18 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  31.18 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  34.05 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  34.95 
 
 		 377 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  31.14 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  52.38 
 
 		 264 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  27.07 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  57.28 
 
 		 106 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  47.93 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  35.82 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  48.51 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  41.67 
 
 		 296 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  47 
 
 		 105 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  41.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  43.7 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.7 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  27.98 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  46.94 
 
 		 108 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  25.63 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  37.21 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  43.44 
 
 		 255 aa  104  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  47 
 
 		 107 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  35.43 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  40.5 
 
 		 286 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  42.98 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  45 
 
 		 103 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0153  hypothetical protein  47.42 
 
 		 103 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296834  hitchhiker  0.0000244541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  42.57 
 
 		 103 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10437  NGG1 interacting factor Nif3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12480)  23.16 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0684928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  45.28 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  37.7 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39650  hypothetical protein  42 
 
 		 105 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0009  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  37.7 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  43.75 
 
 		 274 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  35.43 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2172  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  47.42 
 
 		 103 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  44.34 
 
 		 262 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  38.02 
 
 		 290 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>