198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3344 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  75.14 
 
 		 373 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  73.35 
 
 		 379 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  72.09 
 
 		 374 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  58.27 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  59.48 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  55.53 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  52.16 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  51.56 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  50.26 
 
 		 384 aa  308  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  50 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  38.14 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  35.33 
 
 		 373 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  35.33 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.33 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  35.33 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.14 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  35.33 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  34.86 
 
 		 373 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.52 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  37.47 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  35.05 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  38.02 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  35.88 
 
 		 371 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  36.93 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  38.46 
 
 		 374 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  39.71 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  35.69 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  38.87 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  31.99 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  32.51 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  39.23 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  40.12 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  36.95 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  35.14 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  36.46 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  39.05 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  36.36 
 
 		 372 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.49 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  34.14 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  34.41 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  36.18 
 
 		 372 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  35.31 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  38.99 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  36.18 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  39.6 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  30.27 
 
 		 365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  32.21 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  30.89 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  30.86 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  43.57 
 
 		 361 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  31.44 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  29.32 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  31.47 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  27.69 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  30.19 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  27.22 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  56.83 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  61.36 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  57.58 
 
 		 275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  58.21 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  57.98 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  59.32 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  30.68 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  57.25 
 
 		 268 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  58.2 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  54.2 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  59.32 
 
 		 278 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  54.33 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  58.12 
 
 		 307 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  51.61 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  55 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  52.03 
 
 		 290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  53.49 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  56.41 
 
 		 310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  52.8 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  45.95 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  56.14 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  54.08 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  46.98 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0153  hypothetical protein  41.84 
 
 		 103 aa  99.4  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296834  hitchhiker  0.0000244541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39650  hypothetical protein  41.75 
 
 		 105 aa  99.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  43.69 
 
 		 105 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  50 
 
 		 287 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  41.84 
 
 		 103 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  41 
 
 		 103 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  96.3  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  38.58 
 
 		 264 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3412  hypothetical protein  40.59 
 
 		 105 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.823966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  40.59 
 
 		 103 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  41 
 
 		 105 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  41 
 
 		 105 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>