180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07841 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  744    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  60.33 
 
 
365 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  59.07 
 
 
364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  52.2 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  50 
 
 
364 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  49.45 
 
 
366 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  51.38 
 
 
366 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  49.03 
 
 
367 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  42.31 
 
 
364 aa  320  3e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  42.35 
 
 
369 aa  294  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  35.52 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  37.85 
 
 
368 aa  245  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  37.67 
 
 
373 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  37.23 
 
 
373 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.23 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  37.77 
 
 
371 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  36.96 
 
 
373 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  36.89 
 
 
373 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  36.96 
 
 
373 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.68 
 
 
373 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  36.96 
 
 
373 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  35.23 
 
 
371 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  36.68 
 
 
373 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  36.68 
 
 
373 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.68 
 
 
373 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  36.59 
 
 
373 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  37.95 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.57 
 
 
372 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  36.54 
 
 
373 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  36.59 
 
 
373 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  34.59 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  33.93 
 
 
372 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  34.2 
 
 
371 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  32.97 
 
 
366 aa  205  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  34.44 
 
 
375 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  32.95 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  36.31 
 
 
373 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  32.63 
 
 
369 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  31.17 
 
 
369 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  31.85 
 
 
377 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  31.23 
 
 
380 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  30.79 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  34.99 
 
 
366 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  30.99 
 
 
395 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  33.53 
 
 
372 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  34.42 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  34.42 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  33.23 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  31.04 
 
 
393 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  31.75 
 
 
388 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  30.35 
 
 
379 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  30.35 
 
 
379 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  30.35 
 
 
379 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  34.04 
 
 
361 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  32.54 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  31.32 
 
 
373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  32.11 
 
 
384 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  28.07 
 
 
377 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  28.61 
 
 
373 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  27.52 
 
 
374 aa  159  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  29.15 
 
 
379 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.86 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  31.27 
 
 
373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  27.22 
 
 
330 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  39.2 
 
 
256 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  40.34 
 
 
255 aa  97.4  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  38.58 
 
 
264 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  41.98 
 
 
262 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  36.22 
 
 
290 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  35 
 
 
274 aa  90.5  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  36.13 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  32.81 
 
 
290 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  33.86 
 
 
290 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.11 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.07 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  23.74 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  40.4 
 
 
106 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  36.21 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10437  NGG1 interacting factor Nif3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12480)  35.9 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0684928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  33.9 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0681  structural toxin protein RtxA  41.75 
 
 
118 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280515  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  34.92 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  35.34 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  32.81 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  38.78 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  45.54 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  28.72 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  40.82 
 
 
103 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  32.45 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  34.69 
 
 
107 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3775  hypothetical protein  41.3 
 
 
109 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.33032  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  37 
 
 
103 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  29.23 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  37 
 
 
103 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  29.6 
 
 
306 aa  77  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  37.76 
 
 
103 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  36.8 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  33.9 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  31.34 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  33.03 
 
 
241 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>