240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1955 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  544  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  73.19 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  68.27 
 
 		 278 aa  347  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  73.08 
 
 		 286 aa  341  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  68.73 
 
 		 268 aa  325  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  58.24 
 
 		 279 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  54.41 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  52.52 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  55.64 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  58.76 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  52.57 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  51.28 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  57.78 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  56.07 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  50.17 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  51.26 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  59.66 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  45.88 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  46.62 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  46.37 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  50.2 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  43.59 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  36.64 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  68.94 
 
 		 393 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  35.89 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  69.77 
 
 		 380 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  35.48 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  64.66 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  37.5 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  39.44 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  34.13 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  62.31 
 
 		 384 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  61.02 
 
 		 346 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  34.6 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  35.32 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  56.92 
 
 		 373 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  54.48 
 
 		 377 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  49.24 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  58.21 
 
 		 379 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  34.25 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  28.31 
 
 		 256 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  47.45 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  29.06 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  46.76 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  46.76 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  46.76 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  31.68 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  33.49 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  46.72 
 
 		 373 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  30.51 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  30.31 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  31.4 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  29 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  30.25 
 
 		 263 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.38 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  40.52 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  40.52 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  40.52 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  40.52 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.52 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.52 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  39.66 
 
 		 373 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  41.38 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  30.83 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  41.38 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  32.41 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  41.67 
 
 		 371 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  48.74 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  39.83 
 
 		 373 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  43.8 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  43.97 
 
 		 370 aa  93.2  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  31.15 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  38.83 
 
 		 368 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  36.44 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  48 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  42.15 
 
 		 372 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  42.16 
 
 		 371 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.52 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  25.22 
 
 		 262 aa  89  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  28.92 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  37.61 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  45.08 
 
 		 388 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  32.4 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  33.05 
 
 		 371 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  27.13 
 
 		 254 aa  86.3  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  37.21 
 
 		 369 aa  85.5  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  23.62 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  46.53 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  38.26 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  46.53 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  38.83 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  35.54 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  36.07 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  35.16 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  25.61 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  28.08 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  35.9 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>