219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3123 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  100 
 
 
366 aa  752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  61.75 
 
 
366 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  55.28 
 
 
365 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  53.42 
 
 
367 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  52.89 
 
 
364 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  50.96 
 
 
365 aa  394  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  51.38 
 
 
364 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  48.48 
 
 
364 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  46.61 
 
 
369 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  46.13 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  41.67 
 
 
381 aa  292  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  38.44 
 
 
371 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  39.14 
 
 
372 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  37.26 
 
 
368 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  40.99 
 
 
374 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.21 
 
 
373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.52 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  41.21 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  41.52 
 
 
373 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  40.61 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  41.21 
 
 
373 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  41.21 
 
 
373 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  38.06 
 
 
370 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  41.21 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.21 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  40.48 
 
 
373 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  35.89 
 
 
371 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  38.74 
 
 
375 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  39.7 
 
 
373 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  34.23 
 
 
372 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.27 
 
 
372 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  34.77 
 
 
388 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  38.72 
 
 
373 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  35.92 
 
 
372 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  36.23 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  33.69 
 
 
372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  38.17 
 
 
380 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  36.31 
 
 
373 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  36.6 
 
 
388 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  33.7 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  37.6 
 
 
373 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  33.88 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  32.09 
 
 
377 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  36.87 
 
 
369 aa  209  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  36.61 
 
 
393 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  34.68 
 
 
373 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  34.9 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  35.77 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  35.1 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  31.56 
 
 
374 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  32.6 
 
 
373 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  33.24 
 
 
379 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  33.24 
 
 
379 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  33.24 
 
 
379 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  32.79 
 
 
366 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  38.05 
 
 
361 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  32.79 
 
 
366 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  38.07 
 
 
373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  31.53 
 
 
373 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  32.46 
 
 
377 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  35.28 
 
 
384 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  32.14 
 
 
379 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.82 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  31.17 
 
 
330 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  34.76 
 
 
256 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  40.83 
 
 
255 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  39.83 
 
 
264 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  41.94 
 
 
274 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  41.32 
 
 
262 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  27.03 
 
 
336 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.55 
 
 
269 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  40.5 
 
 
262 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  35.43 
 
 
290 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  42.24 
 
 
262 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  37.19 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  36.22 
 
 
290 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  34.38 
 
 
279 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  31.75 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  38.84 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  39.62 
 
 
274 aa  90.1  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  37.9 
 
 
257 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  36.09 
 
 
286 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  32.06 
 
 
255 aa  86.3  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  33.61 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  31.25 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  32.84 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  37 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  41.41 
 
 
106 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  38.71 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  35.9 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  36.27 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  31.78 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  36.27 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  39.37 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  29.63 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  36.27 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  38.24 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  35.48 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  32.8 
 
 
307 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>