270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1210 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  37.69 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  37.09 
 
 
296 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  32.97 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  37.69 
 
 
279 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  32.17 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  36.84 
 
 
240 aa  152  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  37.45 
 
 
278 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  31.78 
 
 
262 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  40.73 
 
 
273 aa  148  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  38.91 
 
 
268 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  33.45 
 
 
307 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  35.02 
 
 
290 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  34.05 
 
 
310 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  34.55 
 
 
294 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  33.8 
 
 
286 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  34.6 
 
 
278 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  29.92 
 
 
241 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  29.17 
 
 
256 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  27.17 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  34.3 
 
 
290 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  30.6 
 
 
240 aa  135  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  29.1 
 
 
241 aa  135  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  35.48 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  29.51 
 
 
241 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  31.97 
 
 
239 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  35.45 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.2 
 
 
309 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.96 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  34.34 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  31.87 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  36.68 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.42 
 
 
287 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  36.14 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  30.92 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  30.22 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  31.51 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  27.82 
 
 
241 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  29.96 
 
 
240 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  30.45 
 
 
274 aa  125  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  30.8 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.73 
 
 
318 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  28.57 
 
 
255 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  32.71 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  27.49 
 
 
242 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  33.19 
 
 
306 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  30.77 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  40.16 
 
 
372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  33.1 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  38.64 
 
 
377 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  29.48 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  37.88 
 
 
372 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  38.76 
 
 
388 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  40.62 
 
 
374 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  38.58 
 
 
372 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  29.26 
 
 
262 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  29.2 
 
 
246 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  35.29 
 
 
301 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  34.39 
 
 
275 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  36.92 
 
 
372 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  33.59 
 
 
366 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  25.64 
 
 
265 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  33.19 
 
 
291 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  28.4 
 
 
246 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  36.36 
 
 
375 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  39.06 
 
 
371 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  26.78 
 
 
261 aa  102  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  28.4 
 
 
262 aa  102  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  38.71 
 
 
371 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  35.71 
 
 
371 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  26.25 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  27.71 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.58 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  34.4 
 
 
368 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.25 
 
 
372 aa  95.5  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  39.37 
 
 
370 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  26.32 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  24.2 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  29.26 
 
 
366 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  29.26 
 
 
366 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  41.13 
 
 
395 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  39.02 
 
 
373 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  31.75 
 
 
373 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  31.75 
 
 
366 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  39.34 
 
 
381 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  30.95 
 
 
369 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  35.48 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  32.54 
 
 
366 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  31.75 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  31.75 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  31.75 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.75 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.75 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  31.75 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  33.06 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.75 
 
 
373 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  32.48 
 
 
369 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  31.45 
 
 
364 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  31.75 
 
 
373 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  31.75 
 
 
373 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>