239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  52.35 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06950  hypothetical protein  52.4 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.651716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.41 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  32.97 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  33.19 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  28.26 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  33.08 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  31.33 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  32.4 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  31.15 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  30 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  30.89 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  32.08 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.64 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  29.15 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  28.74 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  31.11 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  33.19 
 
 		 268 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  30.07 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  30.8 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  27.85 
 
 		 241 aa  90.1  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  29.31 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  26.89 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  26.89 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  25.42 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  27.08 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  25.73 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  26.67 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  30.8 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  35.66 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  30.71 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  33.64 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  27.74 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  27.39 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  22.88 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  31.56 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  23.86 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  30.52 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.63 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  25.52 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  28.93 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  37.61 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0358  NIF3 family protein  23.53 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0554308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  29.28 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  32.24 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  33.61 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  24.1 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  33.86 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  33.86 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  31.34 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  38.1 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  40.66 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  28.11 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  29.46 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  34.38 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.74 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  26.45 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  26.04 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  24.46 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  27.8 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  33.07 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  34.35 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  35.87 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  30.08 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  26.69 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  35.51 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  34.07 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  39.81 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  36.56 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  32.79 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  35.58 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  26.9 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  32.41 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  27.69 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  26.72 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  29.51 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  26.72 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  26.72 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  37.37 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  28.45 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  28.45 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  37 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  26.34 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  27.27 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  28.06 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  24.03 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  26.7 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  33.7 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.58 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  25.77 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  27.04 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  27.9 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  23.65 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  31.01 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  23.6 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>