156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0358 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0358  NIF3 family protein  100 
 
 
262 aa  523  1e-147  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0554308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  33.73 
 
 
259 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  30.26 
 
 
256 aa  92  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  30.49 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  28.8 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  23.26 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  25.97 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0501  hypothetical protein  26.27 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00505671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  36.59 
 
 
366 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  36.59 
 
 
366 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  24.28 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  24.89 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  24.55 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  25.36 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  37.69 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  30.71 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  24.03 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  23.67 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  36.07 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  27 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  26.16 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  36.07 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  26.58 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  27 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  26.58 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  23.53 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  23.67 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  26.7 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  25.91 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  26.99 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  28.93 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  30.25 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  27.14 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  30 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  26.98 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  22.95 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  22.43 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  35.77 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  27.31 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  36.67 
 
 
371 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  23.75 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  32.26 
 
 
372 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  23.81 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  30.83 
 
 
367 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  26.09 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  26.79 
 
 
372 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  33.08 
 
 
366 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  31.93 
 
 
364 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  22.51 
 
 
301 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  25.94 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  24.83 
 
 
384 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  31.01 
 
 
381 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06950  hypothetical protein  21.72 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.651716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  32.26 
 
 
368 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  21.62 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  30.65 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  32.26 
 
 
369 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  22.27 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  27.48 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  23.28 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  32.26 
 
 
373 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  33.63 
 
 
365 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  28.8 
 
 
374 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  30.89 
 
 
370 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  25.65 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  22.75 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  32.26 
 
 
373 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  32.26 
 
 
373 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  32.26 
 
 
373 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  29.79 
 
 
388 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.26 
 
 
373 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.26 
 
 
373 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  20.98 
 
 
290 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.26 
 
 
373 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  32.26 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  26.23 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  23.46 
 
 
373 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  31.97 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  24.15 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  23.02 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  24.49 
 
 
393 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  26.56 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  29.31 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  22.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  28.83 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  32.23 
 
 
375 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.32 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  29.69 
 
 
364 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  28.32 
 
 
372 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  26.72 
 
 
395 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  32.26 
 
 
373 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  34.17 
 
 
373 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  31.45 
 
 
373 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  26.98 
 
 
380 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  26.4 
 
 
364 aa  55.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  31.53 
 
 
366 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  25.1 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>