185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1542 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 365 aa  747    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  60.33 
 
 		 364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  61.16 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  52.07 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  50.96 
 
 		 366 aa  394  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  50.82 
 
 		 365 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  50.83 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  47.25 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  46.74 
 
 		 369 aa  335  5e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  41.05 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  36.78 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  37.06 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  36.89 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.26 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  39.94 
 
 		 373 aa  235  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  37.98 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  37.7 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  37.7 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  37.7 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  36.99 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.71 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.74 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  37.6 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  36.92 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  36.81 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  39.29 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.37 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  37.26 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  36.6 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.68 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  37.72 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  35.05 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  35.24 
 
 		 372 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  35.54 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  32.78 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  35.24 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  35.6 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  36.14 
 
 		 372 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  31.71 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  35.15 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  35.15 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  36.1 
 
 		 375 aa  205  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  34.22 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  31.64 
 
 		 371 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  32.33 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  33.03 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  34.73 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  32.85 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  32.36 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  33.43 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  29.73 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  29.73 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  29.73 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  28.38 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  34.76 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  28.34 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  29.88 
 
 		 379 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  30.68 
 
 		 384 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  28.95 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  30.53 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  32.27 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  27.45 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  25.86 
 
 		 324 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  36.62 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.71 
 
 		 269 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  35.2 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  32.39 
 
 		 241 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  34.11 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  31.82 
 
 		 241 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  38.28 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  32.12 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  35.9 
 
 		 287 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  36.51 
 
 		 290 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  36.21 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  36.21 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  30.84 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  39.5 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  32.26 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  36.13 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  30.95 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  34.71 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  33.08 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  39.25 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  30.23 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  35.24 
 
 		 107 aa  80.5  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  24.72 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  39.32 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  36.73 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  39.81 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.67 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  34.13 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  35.54 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  33.61 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  36.97 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  35 
 
 		 103 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  39.39 
 
 		 106 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>