258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3357 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  88.28 
 
 		 290 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  63.3 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  58.36 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  58.63 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  62.14 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  59.93 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  57.78 
 
 		 278 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  55.27 
 
 		 279 aa  258  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  54.93 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  50.34 
 
 		 318 aa  234  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  51.45 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  53.51 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  51.05 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  45.14 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  49.65 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  43.11 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  42.29 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  46.58 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  46.89 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  47.89 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  44.29 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  36.55 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  61.54 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  63.64 
 
 		 393 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  31.67 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  35.02 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  31.79 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  61.83 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  58.27 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  64.23 
 
 		 384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  32.02 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  32.02 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  51.91 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  30.38 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  30.86 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  53.08 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  53.08 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  53.08 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  54.26 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  27.89 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  53.03 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  28.74 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  52.67 
 
 		 373 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  33.2 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  30.3 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  32.65 
 
 		 263 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  47.3 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  32.26 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  52.63 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  30.64 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  30.19 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.73 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  30.34 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  40.94 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  40.94 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.94 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.94 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  40.94 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  40.16 
 
 		 373 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  40.16 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  41.27 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  40.94 
 
 		 373 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  40.94 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  27.57 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  36.36 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  28.73 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  38.4 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  30.2 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  39.84 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.36 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  36.51 
 
 		 367 aa  99  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  31.11 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  43.81 
 
 		 388 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  40 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  35.38 
 
 		 377 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  40.94 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  39.37 
 
 		 373 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  35.08 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  37.01 
 
 		 373 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  36 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  27.53 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  40.83 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  40.83 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  41.46 
 
 		 370 aa  93.2  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  34.4 
 
 		 388 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  35.66 
 
 		 375 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  40.65 
 
 		 373 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  36.22 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  37.29 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  41.09 
 
 		 381 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  33.05 
 
 		 371 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  25.7 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  33.87 
 
 		 365 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  39.83 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  36.51 
 
 		 365 aa  86.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.29 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>