231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16660 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  566  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  47.12 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  45.99 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  45.94 
 
 
279 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  47.91 
 
 
286 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  45.23 
 
 
290 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  42.75 
 
 
310 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  42.75 
 
 
307 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  44.96 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  46.15 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  43.71 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  40.97 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  43.59 
 
 
278 aa  178  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  44.89 
 
 
290 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  35.79 
 
 
306 aa  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  43.75 
 
 
278 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.46 
 
 
318 aa  175  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  48.13 
 
 
268 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  35.63 
 
 
294 aa  175  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.77 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  45.42 
 
 
275 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  44.33 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  43.3 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.5 
 
 
287 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  34.55 
 
 
279 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  51.18 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  26.55 
 
 
264 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  27.31 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  26.92 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  25.48 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  27.73 
 
 
259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  48.85 
 
 
395 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  27.05 
 
 
274 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  46.72 
 
 
393 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  33.5 
 
 
274 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  25.48 
 
 
256 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  27.7 
 
 
265 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  48.41 
 
 
346 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  50.82 
 
 
384 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  44.68 
 
 
377 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  42.58 
 
 
373 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  31.87 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  27.14 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  29.13 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  30.88 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  37.9 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  44.03 
 
 
379 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  23.69 
 
 
242 aa  89.7  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  35.25 
 
 
373 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  38.99 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  38.99 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  38.99 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  34.27 
 
 
371 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  41.79 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  43.28 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  32.5 
 
 
368 aa  86.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  36.36 
 
 
370 aa  85.9  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  25.66 
 
 
262 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  29.32 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  46.03 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  25.66 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.79 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  40.43 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  40.43 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  31.97 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  22.36 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  31.97 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  31.97 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.97 
 
 
373 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  31.97 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.97 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  31.97 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  23.11 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  31.75 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  31.53 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  34.13 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  24.61 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  23.89 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  31.97 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  21.95 
 
 
241 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  25.81 
 
 
246 aa  79  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  20.82 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  31.15 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  22.36 
 
 
240 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  30.4 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  31.97 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  29.92 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  33.33 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  30.4 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  27.76 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  34.96 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  24.09 
 
 
257 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10437  NGG1 interacting factor Nif3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12480)  26.91 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0684928  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  35 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  27.74 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  22.95 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  27.56 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  28.69 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  31.71 
 
 
373 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>