243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2150 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  754    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  37.81 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  42.7 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  44.29 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  41.82 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  39.08 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  41.4 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  42.16 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  39.62 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  39.3 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  40.75 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  41.32 
 
 		 374 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  42.58 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  40.21 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  42.29 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  40.56 
 
 		 373 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  35.92 
 
 		 368 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  37.06 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.33 
 
 		 373 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  36.78 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.78 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  36.78 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  36.78 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  36.78 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.78 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  36.24 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  36.24 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  40.8 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  38.93 
 
 		 373 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  36.16 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  35.12 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  36.24 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  40.44 
 
 		 393 aa  222  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  36.89 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  36 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  36.73 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  32.99 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  34.68 
 
 		 366 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  32.71 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  34.97 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  35.65 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  39.03 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  36.9 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  32.85 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  36.26 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  40.11 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  39.65 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  32.76 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  29.08 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  30.35 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  30.35 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  38.11 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  38.11 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  38.11 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  37.43 
 
 		 379 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  39.44 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  31.32 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  37.36 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  36.8 
 
 		 374 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  29.51 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  35.59 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  28.27 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  25.34 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  30.65 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  31.4 
 
 		 256 aa  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  28.37 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  47.9 
 
 		 262 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  27.32 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  41.94 
 
 		 279 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  40.16 
 
 		 290 aa  96.3  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  36.8 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  48.48 
 
 		 103 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  37.12 
 
 		 246 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  37.12 
 
 		 246 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  40.31 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  47.96 
 
 		 103 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  35.38 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  48.48 
 
 		 103 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  39.02 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  46.46 
 
 		 103 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  30.22 
 
 		 262 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  37.5 
 
 		 296 aa  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  45.92 
 
 		 103 aa  89  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  38.89 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  38.58 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  35.66 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.95 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  39.02 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  46.94 
 
 		 103 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  30.22 
 
 		 262 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  36.51 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  37.7 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  39.68 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.71 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  35.59 
 
 		 261 aa  86.7  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  40.68 
 
 		 287 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  46.32 
 
 		 103 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.69 
 
 		 269 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>